Samples table

ChemTHEATRE stores and offers the following types of Information about the registered samples.(As of February 19, 2020)


RequiredCategoryTitleDescriptionRelationship or External Link
General info.ProjectIDID which ChemTHEATRE assigns to a projectProjects table
General info.SampleIDID which ChemTHEATRE assigns to a sample
General info.Sample TypeKinds of sample(biotic, abiotic, etc)Sample Type table
BioticTaxonomyIDNCBI Taxonomy IDhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy
General info.Scientific NameBiotic: Scientific name, Abiotic: Water, Sediment, Air
General info.Common Name
General info.Collection Year
General info.Collection Month
General info.Collection Day
General info.Sampling Time (Start/End)
General info.Sampling Time (AM/PM)
General info.Sampling Duration
General info.Weather (Start/End)
General info.Temperature(℃) (Start/End)
General info.Collection Region
General info.Collection Country
General info.Collection Area
General info.Collection Latitude FromGoogle Map, Google Earth
General info.Collection Latitude ToGoogle Map, Google Earth
General info.Collection Longitude FromGoogle Map, Google Earth
General info.Collection Longitude ToGoogle Map, Google Earth
General info.MAPSampling spots are pointed out by inputting Latitude and Longitude
BioticTissue/Organ
BioticTissue_Lipid (%)
BioticTissue_Moist (%)
BioticSexMale, Female, or Unidentified
BioticWeight
BioticWeight_unitg, kg, etc.
BioticLength
BioticLength_unitcm, m. etc.
BioticLength_typebody length, fork length, height, etc.
BioticGrowth Stageadult, juvenile, etc.
BioticAge
BioticDisease
WaterWater Temperature (℃) (Start/End)
WaterpH
WaterDO (mg/L)Dissolved Oxygen (DO)
WaterEC (mS/m)Electrical Conductivity (EC)
WaterSalinity
WaterSS (mg/L)Suspended Solids/Substance (SS)
WaterWater Depth (m)
WaterTransparency (m)
WaterWater Color
SedimentSediment Temperature (℃) (Start/End)
SedimentSediment Depth (m)
SedimentSediment Appearance
SedimentSediment Color
SedimentSediment Surface Color
SedimentSediment Odor
SedimentSediment Impurities
SedimentSediment Moisture (%)(On Site/Analysis)
SedimentIgnition Loss (%)(On Site/Analysis)
SoilSoil Depth (m)
AirWind Direction (Start/End)
AirWind Speed (m/s)(Start/End)
AirFlow Rate
AirHumidity (%) (Start/End)
AirAmount of Collected Air (Start/End)
AirMean PM10
AirMean Total Suspended Particles
◯*1General info.Sample Name
◯*1General info.Uniq CodeExternal database (Open to the public)
◯*2General info.Uniq Code Type
General info.Remarks
  • *1: Either of them are required.
  • *2: Required if the sample has an uniq code.


Samples テーブル

試料に関する情報は下記の通り。(2020/02/19現在)
追加すべき項目があればこちらまで連絡下さい。

必須分類タイトル説明文リレーションシップ or 外部リンク
共通ProjectID各プロジェクトに付すシリアルナンバーProjects テーブル
共通SampleID各サンプルに付すシリアルナンバー
共通Sample Typeサンプルの種類(生物,非生物等)Sample Type テーブル
生物TaxonomyIDNCBI Taxonomy ID / 生物分類http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy
共通Scientific Name生物の場合:学名, 非生物の場合: 水, 底質, 土壌, 大気
共通Common Name一般名
共通Collection Year試料採取年
共通Collection Month試料採取月
共通Collection Day試料採取日
共通Sampling Time (Start/End)サンプリング時間(開始時/終了時)
共通Sampling Time (AM/PM)サンプリング時間(午前/午後)
共通Sampling Durationサンプリング継続時間
共通Weather (Start/End)天候(開始時/終了時)
共通Temperature(℃) (Start/End)温度(℃)(開始時/終了時)
共通Collection Region採取地域
共通Collection Country採取国
共通Collection Area採取地
共通Collection Latitude From採取地緯度Google Map, Google Earth等
共通Collection Latitude To採取地緯度(範囲表示の場合)Google Map, Google Earth等
共通Collection Longitude From採取地経度Google Map, Google Earth等
共通Collection Longitude To採取地経度(範囲表示の場合)Google Map, Google Earth等
共通MAP地図(緯度経度の入力により自動で採取地点を表示)
生物Tissue/Organ(生物)組織または臓器名
生物Tissue_Lipid (%)(生物) 脂質含量 (%)
生物Tissue_Moist (%)(生物)水分含量(%)
生物Sex(生物)性別(男性/女性/不明, オス/メス/不明)
生物Weight(生物)重量
生物Weight_unit(生物)重量の単位(g, kg等)
生物Length(生物)長さ(Length_typeで定義)
生物Length_unit(生物)長さの単位(cm, m等)
生物Length_type(生物)長さの種類 (体長(body length), 尾叉長(fork length), 全長(total length), 身長(height)等)
生物Growth Stage(生物)成長段階(成人/成体(adult), 幼若者(体)/未成熟(juvenile等)
生物Age(生物)年齢
生物Disease(生物)疾病等
Water Temperature (℃) (Start/End)(水)温度(℃)(開始時/終了時)
pH(水)pH
DO (mg/L)(水)溶存酸素量 Dissolved Oxygen (DO)
EC (mS/m)(水)電気伝導率 Electrical Conductivity (EC)
Salinity(水)塩分濃度
SS (mg/L)(水)浮遊物質/懸濁物質 Suspended Solids/Substance (SS)
Water Depth (m)(水)水の深度 (m)
Transparency (m)(水)透明度 (m)
Water Color(水)水の色
底質Sediment Temperature (℃) (Start/End)(底質)底質の温度(℃)(開始時/終了時)
底質Sediment Depth (m)(底質)底質の深度(m)
底質Sediment Appearance(底質)底質の外観
底質Sediment Color(底質)底質の色
底質Sediment Surface Color(底質)底質表層の色
底質Sediment Odor(底質)底質の臭気
底質Sediment Impurities(底質)底質中の不純物
底質Sediment Moisture (%)(On Site/Analysis)(底質)底質の湿度(%)(採取時/測定時)
底質Ignition Loss (%)(On Site/Analysis)(底質)強熱減量(%)(採取時/測定時)
土壌Soil Depth (m)(土壌)土壌の深度 (m)
大気Wind Direction (Start/End)(大気)風向(開始時/終了時)
大気Wind Speed (m/s)(Start/End)(大気)風速 (m/s) (開始時/終了時)
大気Flow Rate(大気)流速
大気Humidity (%) (Start/End)(大気)湿度 (%) (開始時/終了時)
大気Amount of Collected Air (Start/End)(大気)大気採取量(開始時/終了時)
大気Mean PM10(大気)PM10平均値
大気Mean Total Suspended Particles(大気)総浮遊粒子 平均値
◯*1共通Sample Name登録者が独自に付けた試料名
◯*1共通Uniq Codeサンプルに付された固有ID(公開されているものに限る)外部データベース(公開されているもの)
◯*2共通Uniq Code Type固有IDの種類(愛媛大学es-BANK,国立科学博物館等)
共通Remarks備考 その他試料に関する情報
  • *1:いずれかの試料IDが必須となる。
  • *2:Uniq Code を有する試料では必須となる。

Change log (変更履歴)

2020/02/17 共通する項目の他に、生物、水、底質、土壌、大気に特有な項目を追加しました。
2016/09/28 試料採取年月日をそれぞれ別カラムにしました。
2016/07/08 "Age"と"Disease"を追加しました。
2016/07/07 テーブル情報をアップしました。


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Last-modified: 2020-03-30 (月) 12:21:10 (107d)