ようこそChemTHEATRE Wikiへ!

ChemTHEATREとは・・・

  • 既に論文、報告書として発表されている環境中の化学物質のモニタリングデータを統一のフォーマットにて集積

  • 有益、貴重なデータをシンプルな形で保存、活用に繋げるデータベース
    →詳しくはChemTHEATREの紹介

目次

データ登録の仕方・流れ

1. register@chem-theatre.com へメール

  • 添付する物:
  • 論文(supporting infoもあれば): pdfなど

  • 測定値と検出下限値(生データ):excelなど

  • サンプルの情報(採取年月日、採取地点の緯度経度など):excelなど

2. 登録担当者が論文、生データを元にChemTHEATREのフォーマットに加工

  • 正確を期すため、この段階で不明箇所等を提供者へ問合せ

3. ChemTHEATREへアップロード

4. 登録完了通知と共に、データ提供者にはデータ、メタデータを1つのエクセルファイルにまとめて返却


データ提供の利点(Submitter)

論文、報告書の内容を幅広く認知、引用、活用してもらえる

  • doiを登録。ChemTHEATREから論文へワンクリックで!

オンラインストレージとして利用できる

  • 学生や研究員の卒業・異動によるデータや周辺情報の紛失をゼロに!

  • PCの紛失・故障があってもデータはいつでも手元に

  • 外出先でも閲覧可能

自分のデータをいつでもダウンロードできる(さらなる研究に即活用可能)

  • 年数の経ったデータも振返り、比較が容易!

ファイリングは人に任せて、自分の時間は研究にあてられる!

  • 他者の目を通して、生データとメタデータの有無や内容を整理整頓

  • 生データ+メタデータ+論文や報告書を1つにつないでChemTHEATRE内に保管
    →登録完了時に上記データを1つのエクセルファイルにまとめて返却。オンラインと手元で大切なデータを保管可能

    chemwiki_figures.png


    • メタデータとは・・・
      • 使用したサンプルの情報 (採取年月日、採取場所の情報(緯度経度、地名など)pH, 水温、気温、深度、学名、性別、成熟度、臓器・組織名、体長、重量など)
        →詳しくはSamplesテーブル

      • 測定方法・条件
        →詳しくはExperimentsテーブル

      • 化学物質情報など
        →詳しくはChemicalsテーブル

収録データ活用の利点 (User)

統一のフォーマット、統一した単位で掲載しているので使い勝手がよい

  • 水:μg/L, 生物/土/底質: ng/g など

論文等では「平均値」などでまとめられているデータもここでは実測値を収録

登録時に第三者がデータやメタデータをチェックし、確実な情報とデータのみを収録

場所、化学物質、時間といった様々なフィルターをかけてデータを閲覧可能

  • 検索条件を入れることで膨大なデータを絞り込み。必要な情報をピンポイントに抽出、tsvファイルでエクスポートが可能

経年、物質ごと、地域ごとの比較研究が容易に


ChemTHEATREにはどんな情報が登録されている?

データ検索の仕方

アプローチの仕方は3つ

エクスポートの仕方

必要なサンプル情報、測定値情報をtsvファイルでダウンロード可能

サイトを利用するにあたり

学会等での発表

2019年

  • SETAC North America 40th Annual Meeting(2019年11月3日〜7日,トロント)
    Utilization of a web-based tool ChemTHEATRE in exposure and risk assessments for chemicals
  • 2019年日化協LRI研究報告会(2019年8月30日,東京)
    環境中の化学物質のモニタリング情報を管理するプラットフォーム(ChemTHEATRE)の構築と活用
  • 第28回環境化学討論会(2019年6月12日〜14日,埼玉)
    ChemTHEATREとAIST-MeRAMの統合利用による化学物質のリスク評価
  • 9th International Conference on Marine Pollution and Ecotoxicology(2019年6月10日〜14日,香港)
    Integrated use of ChemTHEATRE and AIST-MeRAM for rapid and cost-effective risk assessment of environmental contaminants
  • SETAC Europe 29th Annual Meeting(2019年5月26日〜30日,ヘルシンキ,フィンランド)
    ChemTHEATRE promotes utilization of the published or public data of environmental contaminants for chemical exposure and risk assessment
  • 第53回日本水環境学会年会(2019年3月7日〜9日,甲府)
    ChemTHEATREによる環境中の化学物質モニタリング情報のオープンデータ化〜その重要性と課題〜

2018年

  • 第21回環境ホルモン学会研究発表会(2018年12月15日〜16日,東京)
    環境モニタリングのためのオープンデータプラットフォーム「ChemTHEATRE」
  • SETAC North America 39th Annual Meeting(2018年11月4日〜8日,サクラメント,アメリカ)
    ChemTHEATRE, a platform to browse the published or public data of environmental monitoring and its use for risk assessment
  • トーゴーの日シンポジウム2018(2018年10月5日,東京)
    化学物質の環境リスク評価・リスクコミュニケーションのための公共データの活用およびChemTHEATREとAIST-MeRAMの統合利用
  • 2018 SETAC Asia-Pacific Conference(2018年9月16日〜19日,テグ,韓国)
    ChemTHEATRE: opendata platform for environmental monitoring of POPs and other contaminants
  • 第24回日本環境毒性学会研究発表会(2018年9月11日〜12日,岐阜)
    化学物質の環境モニタリング情報に関連するオープンデータの活用基盤(ChemTHEATRE)の構築
  • 38th International Symposium on Halogenated Persistent Organic Pollutants & 10th International PCB Workshop: DIOXIN 2018(2018年8月26日〜31日,クラクフ,ポーランド)
    Temporal trend analyses of POPs in three toothed whale species stranded along the Japanese coastal waters: importance of samples and data stored in es-BANK and ChemTHEATRE
  • Water and Environment Technology Conference 2018 (WET2018)(2018年7月14日〜15日,松山)
    Introduction to ChemTHEATRE: a platform to utilize the published or public data of environmental monitoring
  • 第27回環境化学討論会(2018年5月22日〜25日,那覇)
    環境中の化学物質濃度情報を管理するプラットフォーム「ChemTHEATRE」の機能拡張とメタデータ利活用の基盤整備

2017年

  • SETAC North America 38th Annual Meeting(2017年11月12日〜16日,ミネアポリス,アメリカ)
    Introduction to ChemTHEATRE: Open data leads to a new era for the risk evaluation and communication
  • トーゴーの日シンポジウム2017(2017年10月4日〜5日,東京)
    化学物質の環境リスク評価・リスクコミュニケーションのためのデータベース統合利用の試み
  • 第20回日本水環境学会シンポジウム(2017年9月26日〜28日,和歌山)
    環境モニタリング情報のデータベース化〜ChemTHEATREの取り組みと課題〜
  • The 14th International Symposium on Persistent Toxic Substances(2017年9月24日〜28日,名古屋)
    Persistent organic pollutants in melon-headed whales stranded along the Japanese coastal waters: temporal trend analyses using samples and data stored in es-BANK and ChemTHEATRE
  • 37th International Symposium on Halogenated Persistent Organic Pollutants: DIOXIN2017(2017年8月20日〜25日,バンクーバー,カナダ)
    Temporal trends of brominated flame retardants and organochlorines in melon-headed whales stranded along the Japanese coastal waters: utilization of samples and data stored in es-BANK and ChemTHEATRE
  • 19th International Symposium on Pollutant Responses in Marine Organisms (PRIMO19)(2017年6月30日〜7月3日,松山)
    Establishment of the platform 'ChemTHEATRE' to manage monitoring data of environmental contaminants in marine organisms
  • ICCA-LRI and JRC Workshop(2017年6月21日〜22日,コモ,イタリア)
    Introduction to ChemTHEATRE: Open data leads to a new era for integrated exposure and effects analysis
  • 第26回環境化学討論会(2017年6月7日〜9日,静岡)
    環境中の化学物質濃度情報を管理するプラットフォーム「ChemTHEATRE」の利活用

2016年

  • 環境ホルモン学会第19回研究発表会(2016年12月8日〜9日,つくば)
    環境中化学物質の濃度情報に関するデータベース「ChemTHEATRE」によるモニタリング情報の管理と活用
  • 7th SETAC World Congress/SETAC North America 37th Annual Meeting(2016年11月6日〜10日,オーランド,アメリカ)
    A brief introduction to ChemTHEATRE, the platform to manage the monitoring data of chemicals in environment
  • 第19回日本水環境学会シンポジウム(2016年9月13日〜15日,秋田)
    モニタリングデータの有効活用 〜環境中の化学物質濃度データベース「ChemTHEATRE」の構築〜
  • 第22回日本環境毒性学会研究発表会(2016年9月6日〜7日,松山)
    環境中の化学物質濃度情報を管理するプラットフォーム「ChemTHEATRE」の構築
  • 8th International Conference on Marine Pollution and Ecotoxicology(2016年6月20日〜24日,香港)
    ChemTHEATRE— a platform to manage the monitoring data of chemicals in environment
  • ICCA-LRI and NIHS Workshop(2016年6月15日〜16日,淡路島)
    Development of the platform to manage the monitoring data of chemicals in environment, ChemTHEATRE
  • 第25回環境化学討論会(2016年6月8日〜10日,新潟)
    環境中の化学物質濃度情報を管理するプラットフォーム「ChemTHEATRE」の構築

今後の発表予定


添付ファイル: filechemwiki_figures.png 13件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_samplesearch20200214.pdf 17件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_export20200214.pdf 13件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_projectsearch20200214.pdf 19件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_sitepolicy_20200129rev.pdf 11件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_chemicalsearch20200214.pdf 32件 [詳細] filedata_link.png 17件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_en20200227.pdf 93件 [詳細] fileChemTHEATRE_Manual_20200129rev.pdf 76件 [詳細] fileワイングラス.jpg 82件 [詳細] filepukiwiki.png 156件 [詳細]

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Last-modified: 2020-06-17 (水) 16:25:36 (27d)